De zaak van Chen mobiliseerde een grassroots advocacy-netwerk van bezorgde Chinees-Amerikaanse burgers, die het bewustzijn over haar ervaring verhoogden, namens haar lobbyden bij leden van het Congres en geld inzamelden voor haar juridische verdediging. Een van deze groepen zou later worden APA Justitieeen van de meest uitgesproken en consistente stemmen tegen het China-initiatief en raciale profilering.
Wanneer nieuws brak dat Chinees-Amerikaanse academici in 2019 opnieuw werden onderzocht en beëindigd op verdenking van spionage, werden de netwerken die oorspronkelijk waren opgericht om Chen te ondersteunen opnieuw geactiveerd.
Voor veel waarnemers waren de parallellen duidelijk. “Met het China-initiatief hebben we verschillende mislukte en zwakke vervolgingen gezien. Mevrouw Chen is in dat opzicht zeker niet de enige,” vertelde Ashley Gorski, een senior stafadvocaat bij het ACLU National Security Project, dat Chen hielp vertegenwoordigen, aan MIT Technology Review.
Chen werd in 2014 gearresteerd en beschuldigd van spionage door de FBI, die beweerde dat ze illegaal toegang had tot een overheidsdatabase om gevoelige informatie over Amerikaanse dammen te delen met Chinese wetenschappers. Nader onderzoek wees uit dat Chen in feite een gedeeld wachtwoord, algemeen bekend binnen haar kantoor, had gebruikt om toegang te krijgen tot een database voor haar werk. Het gebrek aan bewijs leidde ertoe dat het ministerie van Justitie de aanklacht vijf maanden na het indienen ervan liet vallen. Toch werd Chen ontslagen uit haar baan – om dezelfde nu in diskrediet geraakte redenen die leidden tot de FBI-aanklachten.
De foutieve informatie kwam van de Investigations and Threat Management Service (ITMS) van het Commerce Department, een interne beveiligingseenheid die een Senaatsonderzoek juli 2021 gevonden was betrokken geweest bij brede patronen van ongegrond, discriminerend onderzoek gericht op Chinees-Amerikaanse en andere werknemers – en die de zaak van Chen noemden als een voorbeeld van wangedrag. ITMS werd kort na de publicatie van het rapport opgeheven.
In de tussentijd diende Chen een onrechtmatige beëindigingsklacht in bij de Merit Systems Protection Board, een quasi-rechterlijke instantie die toezicht houdt op arbeidszaken waarbij federale werknemers betrokken zijn, en won. Maar het ministerie van Handel, dat toezicht houdt op de National Weather Service, ging in beroep. Personeelstekorten bij de MSPB zorgden ervoor dat het beroep jarenlang in het ongewisse bleef, dus in 2019 diende Chen een civiele procedure tegen de regering van de Verenigde Staten wegens kwaadwillige vervolging en valse arrestatie. Haar juridische team eiste een schadevergoeding van $ 5 miljoen.